疏水層的處理難度很大，采用疏水層材料，解決了下雨、澆水時多余水分的過濾、排放問題，不會造成積水而導致植物根系腐爛。腐殖土等分量輕、營養高的土壤;為減輕水分和土壤對屋頂的滲漏和腐蝕，屋頂花園將采用噴灌、滴灌等方法“細水長流”，排水系統也需鄭重考慮;為防止水分蒸發過快，土壤中還將加入高分子保水劑。

  泥炭可作為主要的栽培基質，它的容重很小，一般干重在0.2-0.3克/平方厘米間，而普通土壤的容重是1.25-1.75克/厘米3,濕重約在1.9-2.1克/厘米3間。由此可以推算出泥炭在干重時是普通土壤重量的18-20%，而濕重是普通土壤重的33%，建造屋頂花園如果100%用泥炭，則可減輕2/3--3/4的重量。當然，建造屋頂花園不可能全用泥炭。一則全用泥炭相對成本偏高，二則全用泥炭的最大缺陷是抗風固根力不夠強。因此在實際使用中一般采用在二份普通土中滲入一份泥炭做成混合土來建造屋頂花園。或者還可加入適量的糠灰。這樣不僅可減輕土基重量的25-30%，而且也改善了土基的透氣性和土基的養分，所以說，泥炭是建造屋頂花園的理想材料。

  采用APP防水卷材對付屋頂滲漏，效果非常好。這是一種采用無規聚丙烯等制成的新型防水材料，不僅能耐腐蝕、抗老化，還能防止植物根須的侵入。屋頂防水層上面有土壤和植物覆蓋，如果發生滲漏，很難發現漏點，無法根治;花草生存，離不開水和肥料，如果屋頂長期保持濕潤狀況，再加上肥料中含酸、堿、鹽物質的腐蝕，都對防水層造成持續的破壞，如果防水材料防水性能、防腐性能不穩定，那么花園下面的住宅是無法入住的;另外，花草都有根須，根須無孔不入，如果防水層次搭接部位或材料本身有孔隙，根須即會侵入并擴展，使防水層失效。目前國內最大的APP卷材生產廠沈陽藍光新型防水材料有限公司，已經與上海、北京的一些房地產開發商合作，采用聚酯卷材和抗根卷材建造了幾個屋頂花園，取得了成功的經驗。

  APP是以無規聚丙烯等高分子聚合物改性瀝青制成的一種新型防水材料，其抗拉力、抗撕破力、不透水性、延伸率、耐老化性、耐腐蝕性都很好，使用壽命長達10年以上，而且還研制出了防止植物根須破壞防水層的抗根卷材，并開始用于屋頂花園試點工程，防水效果很好。由藍光公司獨家中標的北京西單文化廣場綠地防水工程，共采用了4萬多平方米藍光APP抗根卷材，對老化期達15年以上，確保草坪下面的地下設施無滲漏。他們的經驗是，用1：2.5水泥砂漿鋪好厚度為20毫米～30毫米的找平層;用3毫米厚的APP聚酯卷材和3毫米厚的抗根卷材做好防水層，用1：3水泥砂漿做好厚30毫米的保護層;用10厘米～15厘米厚的卵石做好排水層;用每平方米250克～300克的聚酯無紡布做好過濾層;最后是25厘米厚的植物土壤層。如此選材和施工，就可根治屋頂花園的滲漏問題。屋頂花園的人工土壤層一般要有防水層、過濾層、過濾網、粗礫土和種植土五層。防水層中排水系統的設計和安裝非常重要，它將直接影響到防水問題。土壤層的厚度也要根據所選植物的不同而有所不同。像種植草坪至少需要10厘米的種植土層，而一般花木、灌木要20至30厘米，若是小喬木類至少都要在40至50厘米。屋頂花園首先要解決防水問題。目前國內市場上質優價廉的防水材料比比皆是，防水層應該是高強度的，能夠經得起一般性的沖擊和摩擦。同時加強對水資源利用率，減少綠化用水對居民生活的影響，提高環保生態效益。對于構筑物，例如納涼亭，單邊傘，吊床，秋千椅，遮陽傘，庭院椅等可用實木或鋁合金骨架來生產，減輕重量。